坐久了肛门疼痛可能是痔疮、肛窦炎、肛裂的原因，可以通过使用药物以及手术的方式治疗。1、痔疮：至少是常见的一种肛门疾病，是由于肛管或直肠下端静脉充血、肿大导致的，患者会出现局部疼痛、瘙痒的情况，在大便的时候也会有大便带血的症状，如果长期久坐就有可能会造成肛门疼痛的现象。可以在局部涂抹利多卡因乳膏缓解局部的疼痛感，如果症状一直没有得到改善，还需要通过胶圈套扎疗法、红外线凝结疗法治疗。2、肛窦炎：肛窦炎是发生在肛窦、肛门瓣部位的一种炎症，患者会出现排便不尽以及坠胀感，长期久坐也有可能会导致局部疼痛。在急性期最佳的治疗方式就是肛窦切开引流术。3、肛裂：肛瘘也就是肛管皮肤裂开形成的一种小溃疡，如果患者正处于恢复期长期久坐，就有可能会造成局部不透气从而出现疼痛的情况，可以在局部涂抹利多卡因凝胶进行缓解。在恢复过程中不可以吃辛辣刺激的食物，比如葱、姜、蒜、辣椒等，以免疼痛感加重。